Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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