Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhx8O35652 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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