Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Edil3O35474 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Edil3O35474 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms