Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E2f3O35261 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms