Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms