Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms