Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms