Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm5849J3QPE5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm5849J3QPE5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm5849J3QPE5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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