Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

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Length 74 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Gm20696H3BJN7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20696H3BJN7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Gm20696H3BJN7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm20696H3BJN7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20696H3BJN7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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