Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms