Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atad2bE9Q166 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms