Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms