Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms