Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6685D3YYP3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms