Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms