Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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