Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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