Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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