Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1aA2APX8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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