Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Top3bQ9Z321 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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