Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Snx1Q9WV80 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Snx1Q9WV80 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx1Q9WV80 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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