Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Crlf1Q9JM58 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Crlf1Q9JM58 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Crlf1Q9JM58 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Crlf1Q9JM58 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Crlf1Q9JM58 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms