Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms