Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tgm1Q9JLF6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms