Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms