Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms