Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp29Q9ES63 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp29Q9ES63 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp29Q9ES63 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp29Q9ES63 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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