Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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SelenofQ9ERR7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms