Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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