Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms