Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms