Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Capn12Q9ER56 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Capn12Q9ER56 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn12Q9ER56 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms