Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Tspan4Q9DCK3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan4Q9DCK3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms