Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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