Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cab39lQ9DB16 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cab39lQ9DB16 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cab39lQ9DB16 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cab39lQ9DB16 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cab39lQ9DB16 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms