Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms