Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms