Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Odf2lQ9D478 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Odf2lQ9D478 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Odf2lQ9D478 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Odf2lQ9D478 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Odf2lQ9D478 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Odf2lQ9D478 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Odf2lQ9D478 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf2lQ9D478 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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