Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tssk4Q9D411 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tssk4Q9D411 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms