Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms