Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Rfc5Q9D0F6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rfc5Q9D0F6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rfc5Q9D0F6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rfc5Q9D0F6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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