Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms