Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gins3Q9CY94 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms