Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Exo5Q9CXP9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms