Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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