Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snw1Q9CSN1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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