Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Nicn1Q9CQM0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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