Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ndufb9Q9CQJ8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ndufb9Q9CQJ8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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