Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms