Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms